بنیاد فرهنگی حضرت امام محمد باقر (ع) با هدف ایجاد زمینه های مناسب به جهت رشد و شکوفایی نعمت بزرگ استعداد های فوق العاده ،فرزندان اسلام و تحقق رهنمود های ارزشمند رهبری انقلاب اسلامی حضرت آیت الله العظمی امام خمینی (مدظله العالی) در بکار گیری کلیه ی استعداد های موجود در جامعه جهت حصول استقلال همه جانبه و رهایی از وابستگی های غربی و شرقی و به پاس بزرگداشت ارواح طیبه ی شهدای گرانقدر اسلام و ارج نهادن به فداکار های شهدای زنده لزوم شروع جهاد فکری اسلامی ، بیش از پیشتر احساس گردید و بر این اساس افراد احساس مسئولیت شرعی و اجتماعی نموده و بر آن شدند که با برخورداری از امکانات سازمانها ی ذیربط و افراد خیر این سرمایه های بالقوه را حمایت نمایند و ضمن تامین نیاز های مادی و معنوی آنان محیط رشد و تعلیم و تحقیق و تعالی را بروی اینگونه افراد فراهم نمایند. و امید آنکه در پرتوی این خدمت خالصانه از به هدر رفتن و فرار مغز ها و انحراف و سوء استفاده از آن ها جلوگیری و جامعه اسلامی از این استعدادها به نحو احسن بهره مند گردد. لذا بدین منظور و در سایه الطاف خداوندی و عنایت خاص حضرت ولی الله الاعظم حجت بن الحسن العسگری (عج) سازمانی تحت عنوان بنیاد فرهنگی حضرت امام محمد باقر (ع) در سال ۱۳۶۵تشکیل و طی شماره ۱۳۶۹-۴۳۵ به ثبت رسید. در راستای تحقق اهداف پیش بینی شده ، در اساسنامه بنیاد اقدام به تاسیس مدارس غیرانتفاعی نمود .که این واحد آموزشی در سال ۱۳۷۵ تاسیس گردید و از آن سال تاکنون خدمات قابل توجهی را به دانش آموزان عزیز که به حق تشنگان علم و دانش و کسب فضایل اخلاقی و معنوی هستند ارائه نموده و هرسال داوطلبان بسیار زیادی جهت شرکت در آزمون ورودی این واحد آموزشی ثبت نام نموده و جهت ورود به مدرسه رقابت می نمایند .